Перед голосованием членами Центризбиркома было принято решение о проведении открытого голосования «за» или «против» организации референдума, при этом члены ЦИК должны были мотивировать свою позицию.

В рамках открытого голосования все члены ЦИК, назначенные от партий альянса, проголосовали против организации референдума о присоединении Молдовы к Таможенному союзу. Лишь три представителя Центризбиркома, выдвинутые от Партии коммунистов Республики Молдова выступили в поддержку данного референдума, мотивируя свое решение необходимостью соблюдать принцип последовательности.

Основной причиной отказа в организации референдума со стороны правящего большинства в Центризбиркоме стало признание недействительными 153 тысяч подписей по причине того, что персональные данные людей, выступающих за проведение референдума, были внесены в списки рукой сборщика подписей.

«Мы должны быть последовательными и применять единые нормы закона абсолютно ко всем, а не выборочно»,- заявил в рамках заседания член ЦИК, выдвинутый от ПКРМ, Александр Семенов, уточнив, что если в 2010 году был прецедент, когда списки для сбора подписей в поддержку референдума по изменению Конституции в пользу прямого избрания президента, заполняли сборщики подписей, то и «в 2012 мы должны поступать точно так же».

В свою очередь, другой представитель Центризбиркома, выдвинутый от Партии коммунистов Вадим Моцарский, сообщил, что «не согласен с тем, что необходимо исключить 153 тысячи подписей только потому, что эти списки были заполнены сборщиками подписей, а не самими гражданами». «На мой взгляд, статья 42 (4) Кодекса о выборах не дает юридического права ЦИК исключать эти подписи. И эти подписи представляют значительное число из общего количества подписей – порядка 2/3, и это решение мне кажется неверным», - подытожил Моцарский, уточнив, что голосует за проведение референдума.

Сбор соответствующих подписей граждан осуществляла инициативная группа от Социал-демократической партии, возглавляемой Виктором Шелиным. Как заявили члены ЦИК, после тщательной проверки списков с подписями, было установлено, что более 197 тысяч подписей из необходимых 200 тысяч сфальсифицированы или не соответствуют требованиям.

Впервые идея присоединения Молдовы к Евразийскому проекту и Таможенному союзу была озвучена экс-президентом Молдовы, председателем ПКРМ Владимиром Ворониным. По словам Воронина, присоединение Молдовы к этой структуре даст огромные выгоды в социально-экономическом и культурном плане для всех жителей страны.